Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms