Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C11orf49Q9H6J7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms