Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms