Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms