Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc70Q9D9B0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc70Q9D9B0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms