Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Zcchc13Q9D548 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zcchc13Q9D548 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms