Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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