Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM3Q9BZQ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms