Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM62Q9BVG3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms