Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms