Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E2Q96LR5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms