Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms