Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms