Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top1mtQ8R4U6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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