Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms