Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC21AQ8NDW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC21AQ8NDW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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