Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntrobQ8CB62 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntrobQ8CB62 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms