Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sall4Q8BX22 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sall4Q8BX22 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms