Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms