Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms