Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BC061212Q6P8K3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms