Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNP1Q6NT89 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms