Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sycp1Q62209 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms