Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms