Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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