Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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VAMP3Q15836 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP3Q15836 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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VAMP3Q15836 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP3Q15836 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP3Q15836 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP3Q15836 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP3Q15836 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP3Q15836 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP3Q15836 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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VAMP3Q15836 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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VAMP3Q15836 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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VAMP3Q15836 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP3Q15836 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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