Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NR1D2Q14995 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1D2Q14995 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NR1D2Q14995 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NR1D2Q14995 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1D2Q14995 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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