Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBX1Q14549 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms