Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD4Q13485 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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