Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 snR59snR59 78 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 GCS1YDL226C 1059 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 TDH3YGR192C 999 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 TRR2YHR106W 1029 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 RPS24BYIL069C 408 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 TDH2YJR009C 999 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 EMC2YJR088C 879 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 ISF1YMR081C 1017 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 snR36snR36 182 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YBR139WYBR139W 1527 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 ECM3YOR092W 1842 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 HRK1YOR267C 2280 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 BRE5YNR051C 1548 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 ESF1YDR365C 1887 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YDR090CYDR090C 933 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YDR102CYDR102C 333 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YDR274CYDR274C 372 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YER084WYER084W 387 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 RPL1BYGL135W 654 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 RNR4YGR180C 1038 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YLR358CYLR358C 564 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YOR082CYOR082C 342 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 RPL1AYPL220W 654 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 AMD1YML035C 2433 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 SSF1YHR066W 1362 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 TEF1YPR080W 1377 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 TEF2YBR118W 1377 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 STP1YDR463W 1560 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YJR003CYJR003C 1560 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 RPS14AYCR031C 414 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 AST2YER101C 1293 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YGR153WYGR153W 654 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 PUP2YGR253C 783 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 STM1YLR150W 822 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 PKR1YMR123W 369 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YPR099CYPR099C 357 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 TGL3YMR313C 1929 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 THS1YIL078W 2205 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 THI13YDL244W 1023 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 RPC11YDR045C 333 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YKL069WYKL069W 543 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 THI12YNL332W 1023 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 VAM10YOR068C 345 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YPL114WYPL114W 420 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 PEP7YDR323C 1548 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 SPE1YKL184W 1401 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YRB1YDR002W 606 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 ISD11YER048W-A 285 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YGR053CYGR053C 852 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 FMC1YIL098C 468 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 PFD1YJL179W 330 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 RPL19BYBL027W 570 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 SUL2YLR092W 2682 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 CTM1YHR109W 1758 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 ZUO1YGR285C 1302 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 OCA5YHL029C 2040 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 SAC1YKL212W 1872 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YDL068WYDL068W 330 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 COX4YGL187C 468 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YJL182CYJL182C 318 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 TDA8YAL064C-A 381 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 RMP1YLR145W 606 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 HAP3YBL021C 435 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 RAD14YMR201C 1116 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 DCS2YOR173W 1062 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 BI4Q0120 1917 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 TPD3YAL016W 1908 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 TLC1TLC1 1301 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 ELP2YGR200C 2367 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 EXO1YOR033C 2109 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 PHB1YGR132C 864 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 BET5YML077W 480 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YMR122CYMR122C 375 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YOL046CYOL046C 675 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 TMC1YOR052C 453 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 BIL1YOR304C-A 231 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YPR114WYPR114W 948 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 PIN3YPR154W 648 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 ATG4YNL223W 1485 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 MEF2YJL102W 2460 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 PHO84YML123C 1764 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 MON1YGL124C 1935 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 TRF5YNL299W 1929 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 EIS1YMR031C 2532 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 CDC9YDL164C 2268 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 PIF1YML061C 2580 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 CYC7YEL039C 342 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YER079C-AYER079C-A 339 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 SMX2YFL017W-A 234 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YGR117CYGR117C 1431 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 RGI2YIL057C 495 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 YAL037WYAL037W 804 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 TIM18YOR297C 579 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 MET31YPL038W 534 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-DR3Q12441 CBC2YPL178W 627 nt4.93□□□□□ -1.62
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