Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms