Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2BQ02880 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms