Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms