Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 RPL17BYJL177W 555 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 RPL8BYLL045C 771 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YLR076CYLR076C 423 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YLR225CYLR225C 1224 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YBL081WYBL081W 1107 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 RPL23AYBL087C 414 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YKR015CYKR015C 1707 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 ECM18YDR125C 1362 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 HAP4YKL109W 1665 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YKR078WYKR078W 1758 nt2.44□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YLR001CYLR001C 2589 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 PCL9YDL179W 915 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 ERG20YJL167W 1059 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YAR075WYAR075W 474 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 snR11snR11 258 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YOR062CYOR062C 807 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 STE24YJR117W 1362 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YKL100CYKL100C 1764 nt2.43□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YCL076WYCL076W 744 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YDL050CYDL050C 372 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 NSA2YER126C 786 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YIL054WYIL054W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 GCD14YJL125C 1152 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 RSM26YJR101W 801 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 DAD2YKR083C 402 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YLR444CYLR444C 303 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YOL050CYOL050C 321 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 RFM1YOR279C 933 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YPL216WYPL216W 3309 nt2.42□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 BNI4YNL233W 2679 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 SEC26YDR238C 2922 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 TCD1YHR003C 1290 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 SPO16YHR153C 597 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YLR365WYLR365W 333 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YMR310CYMR310C 954 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 MIC27YNL100W 705 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 SAS4YDR181C 1446 nt2.41□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 PSD2YGR170W 3417 nt2.4□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 ARP8YOR141C 2646 nt2.4□□□□□ -2.02
NUP49Q02199 RED1YLR263W 2484 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YPL150WYPL150W 2706 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 HFM1YGL251C 3564 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 PFK27YOL136C 1194 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YPL071CYPL071C 471 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 VHR2YER064C 1518 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 RPO41YFL036W 4056 nt2.4□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 ACA1YER045C 1470 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 EAP1YKL204W 1899 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 DBP10YDL031W 2988 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 snR57snR57 88 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 COA4YLR218C 453 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 COX14YML129C 213 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YET2YMR040W 483 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 KTI11YBL071W-A 249 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YNR062CYNR062C 984 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 GIN4YDR507C 3429 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 AYT1YLL063C 1425 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 NFT1YKR103W 3657 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 HUL5YGL141W 2733 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MLH1YMR167W 2310 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 TRA1YHR099W 11235 nt2.39□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 TAF2YCR042C 4224 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MSS4YDR208W 2340 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 HTA1YDR225W 399 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MRPL38YKL170W 417 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 TAF4YMR005W 1167 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 ATG3YNR007C 933 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SPS4YOR313C 1017 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 ICR1ICR1 3199 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 PST1YDR055W 1335 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SAD1YFR005C 1347 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YOR365CYOR365C 2112 nt2.38□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 UTP15YMR093W 1542 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YCL019WYCL019W 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 ORC1YML065W 2745 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 HAA1YPR008W 2085 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 ARF1YDL192W 546 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 PRP18YGR006W 756 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 DOG1YHR044C 741 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SOL3YHR163W 750 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YKL066WYKL066W 444 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SIC1YLR079W 855 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YNL043CYNL043C 321 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MPP6YNR024W 561 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 CAT5YOR125C 702 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YOR263CYOR263C 408 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MRP2YPR166C 348 nt2.37□□□□□ -2.03
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