Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nbr1P97432 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms