Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms