Protein–RNA interactions for Protein: P62141

Ppp1cb, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cbP62141 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1cbP62141 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppp1cbP62141 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms