Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK2P49760 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLK2P49760 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLK2P49760 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK2P49760 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms