Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRXP46100 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRXP46100 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRXP46100 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRXP46100 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRXP46100 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRXP46100 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRXP46100 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms