Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MCAMP43121 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCAMP43121 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCAMP43121 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCAMP43121 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCAMP43121 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCAMP43121 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCAMP43121 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms