Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx3P42581 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms