Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms