Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1BP36896 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms