Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab5cP35278 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rab5cP35278 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5cP35278 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rab5cP35278 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab5cP35278 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab5cP35278 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab5cP35278 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab5cP35278 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab5cP35278 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab5cP35278 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5cP35278 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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