Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gjc1P28229 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms