Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calb1P12658 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms