Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolP10400 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PolP10400 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PolP10400 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PolP10400 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PolP10400 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PolP10400 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PolP10400 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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