Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSLP07711 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSLP07711 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSLP07711 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSLP07711 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSLP07711 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSLP07711 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSLP07711 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSLP07711 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSLP07711 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSLP07711 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSLP07711 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSLP07711 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSLP07711 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms