Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM2O94769 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM2O94769 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM2O94769 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM2O94769 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM2O94769 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM2O94769 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM2O94769 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM2O94769 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM2O94769 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM2O94769 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms