Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CrxO54751 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxO54751 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxO54751 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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CrxO54751 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxO54751 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CrxO54751 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CrxO54751 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CrxO54751 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CrxO54751 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CrxO54751 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CrxO54751 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CrxO54751 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CrxO54751 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CrxO54751 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CrxO54751 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxO54751 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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